בין אם מטוגנת בוואקום ובין אם טרייה, לאפונה מתוקה יכולה להיות חיי מדף שונים בהתבסס על תנאי האחסון, האריזה והחומרים המשמרים המשמשים, אפונה מתוקה שטוגנה בוואקום היא לרוב בעלת חיי מדף ארוכים יותר מאשר מקבילותיה הטריות בגלל טכניקת האיטום בוואקום ותכולת לחות נמוכה יותר.
בִּכלָל,אפונה מתוקה מטוגנת בוואקוםיכול להישאר טרי במשך חודשים רבים עד שנה או אפילו יותר כאשר נשמר במיכלים אטומים ואטומים היטב ובמקום קר ויבש. כדי להבטיח את איכותם ובטיחותם לצריכה, חיוני לבדוק בתווית המוצר את התאריך המוצע של היצרן "עד המועד האחרון" או "עד לשימוש". ניתן להאריך את חיי המדף שלהם עם אחסון נכון.
